辛酸、后悔、耻辱——人类诞生的负面感情化作诅咒潜伏于日常当中。诅咒是蔓延于世间的灾祸根源，最坏的情况下会导致人死亡。而诅咒，只能通过诅咒来祓除。 拥有惊人身体能力的少年·虎杖悠仁，原本过着普通的高中生活，但某天他为了救下遭到“诅咒”袭击的同伴而吞下了特级咒物“两面宿傩的手指”，自己的魂魄也寄宿了诅咒

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 　　拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 　　“从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 　　在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！

在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。此作的世界观与TYPE-MOON多作共通的世界观基本设定一致，但却是从TYPE-MOON多作共通世界观的1970年代派生

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 　　拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 　　“从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 　　在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！