宇宙世纪0079年1月3日， 7时20分，吉翁公国向地球联邦政府宣战，以被外届称为“独眼巨人”的MS核心部队，在未遭遇算得上是妨害的妨害下，使用装备热核弹头的火箭炮，无差别地摧毁了各殖民地，此外，为了要屠杀殖民地内的全体居民，大量投入神经毒气“G3”。由宣战开始不到40小时的时间，三个区的居民，

　　县立学文高中一年级2班，那里有位刚一入学就得到全校注目的男子，他的名字叫坂本（绿川光 配音）。他戴着黑边框眼镜，个人特征是左眼下的泪痣。他不但相貌英俊，着装整齐，而且眼神凌厉，一举一动都华丽潇洒，帅气爆表，因此总能成为众人的焦点，受到女生们的疯狂追捧，但是也因此引起不少同龄男生的嫉妒，包括同班同

为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。还需要未性别化的“巫女”被派遣担任驾驶员，于是，她们成为了被称为“coru”的战斗小队成员。         &

故事讲述孙策伯符带领着南阳学院一行人前往京都展开”集锷旅行“，而在京都戴着”刀之锷“的继承了战国武将之魂的全新斗士等待着他们，一场以京都地区为舞台的全新战斗即将展开。剧情与动画正篇并没有太大关联，是类似于番外的一集。

幸平创真（松冈祯丞 配音）出生于料理世家，其父经营着一间家庭餐馆，小小年纪的幸平即将父亲当做了榜样，发誓成为父亲那样的料理家。某一日，父亲找到了幸平，希望他能够进入顶级的料理学校“远月学园”深造磨练，背负着父亲的期许，幸平踏上了旅程。 　　在学校里，幸平结识了名为薙切绘里奈（种田梨沙 配音）的少女，